Die vier Ninja-Helden Kai, Cole, Jay und Zane nehmen ihre Aufgaben nicht besonders ernst.

Als sie jedoch in das kleine Dorf Jamanakai geschickt werden, um dort nach dem Rechten zu sehen, ändert sich ihre Einstellung maßgeblich. Sie treffen den Jungen Lloyd - den Sohn ihres Erzfeindes Lord Garmadon - dessen Plan es ist, die gefährlichen Schlangen vom Stamm der Hypnobrai aus der Verbannung zu befreien und damit nicht nur Jamanakai ins Verderben zu stürzen. Die Kreaturen verfügen über Hypnosefähigkeiten, mit welchen sie die Dorfbewohner in ihren Bann ziehen können. Doch den vier Ninja gelingt es, die Schlangen zu besiegen und das Städtchen zu retten. Die Bedrohung ist damit jedoch nicht vorüber, denn Lloyd droht mit weiteren Angriffen. Die Ninja stoßen indes auf eine geheimnisvolle Prophezeihung: es soll noch einen weiteren Ninja geben, der eines Tages über die größte Macht von allen verfügen soll. Jeder möchte dieser Ninja werden, doch der weise Sensei betont, dass mit großer Macht auch großes persönliches Wachstum verbunden ist...